Кыргыз Республикасынын Саламаттык сактоо министрлигинин 5-сентябрь 1997-жылындагы № 187 - буйругунун негизинде Ош шаарында медициналык жана фармация кызматкерлеринин үзгүлтүксүз даярдоо Республикалык борборунун филиалы уюштурулган. (1997-1998жж).

Кыргыз Республикасынын Саламаттык сактоо министрлигинин 31-май 1999-жылындагы № 168 буйругунун негизинде "Кыргыз мамлекеттик медициналык академиянын дипломдон кийинки билим берүү борборунун Оштогу филиалы" ачылган (1999-2001жж).

Кыргыз мамлекеттик медициналык кайра даярдоо жана адистикти жогорулатуу институтунун 5-сентябрь 2001-жылындагы №7 буйругунун негизинде Ош шаарында "Кыргыз мамлекеттик медициналык кайра даярдоо жана адистикти жогорулатуу институтунун" филиалы түзүлгөн.

Кыргыз Республикасынын Саламаттык сактоо министрлигинин 3-сентябрь 2004-жылындагы № 407, Кыргыз мамлекеттик медициналык кайра даярдоо жана адистикти жогорулатуу институтунун 6-сентябрь 2004-жылындагы №215 жана Кыргыз мамлекеттик медициналык академиянын дипломдон кийинки билим берүү борборунун 17-сентябрь 2004-жылдагы № 204 буйруктарынын негизинде Ош шаарында "Дипломдон кийинки медициналык билим берүү борбору" болуп түзүлгөн (2004-2010жж).

Кыргыз Республикасынын Саламаттык сактоо министрлигинин 4-февраль 2010-жылындагы № 58 буйругунун негизинде Ош шаарындагы "Дипломдон кийинки медициналык билим берүү борбору" "Кыргыз мамлекеттик медициналык кайра даярдоо жана адистикти жогорулатуу институтунун түштүк филиалы" болуп кайрадан түзүлгөн.

Кыргыз Республикасынын Саламаттык сактоо министрлигинин 2018-жылдын 7-май айындагы № 314 жана "С.Б.Данияров атындагы Кыргыз мамлекеттик медициналык кайра даярдоо жана квалификацияны жогорулатуу институтунун" 10-июль 2018-жыл № 644 буйруктарынын негизинде "Санжарбек Бакирович Данияров атындагы Кыргыз мамлекеттик медициналык кайра даярдоо жана квалификацияны жогорулатуу институтунун Түштүк филиалы" болуп түзүлгөн.